Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDNQ99608 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNQ99608 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNQ99608 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNQ99608 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNQ99608 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDNQ99608 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNQ99608 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNQ99608 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNQ99608 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNQ99608 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDNQ99608 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDNQ99608 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDNQ99608 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDNQ99608 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDNQ99608 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDNQ99608 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNQ99608 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNQ99608 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNQ99608 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDNQ99608 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDNQ99608 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDNQ99608 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDNQ99608 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDNQ99608 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNQ99608 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNQ99608 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNQ99608 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNQ99608 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDNQ99608 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDNQ99608 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDNQ99608 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNQ99608 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNQ99608 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNQ99608 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDNQ99608 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDNQ99608 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDNQ99608 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms