Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD180Q99467 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD180Q99467 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD180Q99467 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD180Q99467 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD180Q99467 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD180Q99467 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD180Q99467 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD180Q99467 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD180Q99467 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD180Q99467 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD180Q99467 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD180Q99467 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CD180Q99467 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD180Q99467 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD180Q99467 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD180Q99467 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms