Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SRPK1Q96SB4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPK1Q96SB4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPK1Q96SB4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPK1Q96SB4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms