Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSGA13Q96PP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSGA13Q96PP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms