Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFRQ96KR1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZFRQ96KR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFRQ96KR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms