Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCHS1Q96JQ0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCHS1Q96JQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms