Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAF2Q96CS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAF2Q96CS3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAF2Q96CS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAF2Q96CS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms