Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSUN4Q96CB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSUN4Q96CB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSUN4Q96CB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms