Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEIL2Q969S2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEIL2Q969S2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEIL2Q969S2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms