Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM71BQ8TC56 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM71BQ8TC56 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM71BQ8TC56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms