Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC110Q8TBZ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC110Q8TBZ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC110Q8TBZ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC110Q8TBZ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms