Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HIPK4Q8NE63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HIPK4Q8NE63 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK4Q8NE63 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms