Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPRYD3Q8NCJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPRYD3Q8NCJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SPRYD3Q8NCJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPRYD3Q8NCJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms