Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHERPQ8IWX8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHERPQ8IWX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHERPQ8IWX8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms