Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NLRX1Q86UT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NLRX1Q86UT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NLRX1Q86UT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms