Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RD3Q7Z3Z2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RD3Q7Z3Z2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RD3Q7Z3Z2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms