Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM43BQ6ZT52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM43BQ6ZT52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FAM43BQ6ZT52 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms