Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf47Q6ZRZ4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf47Q6ZRZ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf47Q6ZRZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms