Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNI2Q6ZMN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNI2Q6ZMN8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNI2Q6ZMN8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms