Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC174Q6PII3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC174Q6PII3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC174Q6PII3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms