Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCERG1LQ5VWI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCERG1LQ5VWI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCERG1LQ5VWI1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms