Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD1Q5VV17 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD1Q5VV17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms