Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYDE2Q5VT97 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYDE2Q5VT97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.1 ms