Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCNJQ5T5M9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCNJQ5T5M9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNJQ5T5M9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNJQ5T5M9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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