Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0A6

MINDY4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4Q4G0A6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MINDY4Q4G0A6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MINDY4Q4G0A6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MINDY4Q4G0A6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MINDY4Q4G0A6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms