Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00303Q3SY05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00303Q3SY05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00303Q3SY05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms