Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY1Q3B7I2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNPY1Q3B7I2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNPY1Q3B7I2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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