Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NFE2Q16621 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NFE2Q16621 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFE2Q16621 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms