Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRNP35Q16560 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRNP35Q16560 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
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