Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SYCP1Q15431 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYCP1Q15431 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYCP1Q15431 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms