Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EXOSC2Q13868 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
EXOSC2Q13868 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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