Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 HFI1YPL254W 1467 nt6.47□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.46□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.46□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.46□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 AAD15YOL165C 432 nt6.46□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 CPA1YOR303W 1236 nt6.46□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 MSS1YMR023C 1581 nt6.45□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YEA6YEL006W 1008 nt6.45□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 ABZ1YNR033W 2364 nt6.45□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 RPT2YDL007W 1314 nt6.45□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 RPT4YOR259C 1314 nt6.45□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 IMA2YOL157C 1770 nt6.44□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 MNS1YJR131W 1650 nt6.44□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YEL077CYEL077C 3834 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YJL193WYJL193W 1209 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YOR300WYOR300W 309 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 ATG12YBR217W 561 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 KDX1YKL161C 1302 nt6.43□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 ORC5YNL261W 1440 nt6.42□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 DPH2YKL191W 1605 nt6.42□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 PIF1YML061C 2580 nt6.42□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 UTP7YER082C 1665 nt6.42□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 TRK2YKR050W 2670 nt6.42□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 VMA16YHR026W 642 nt6.41□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 MND2YIR025W 1107 nt6.41□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YHC3YJL059W 1227 nt6.41□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 NRD1YNL251C 1728 nt6.41□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 ATF1YOR377W 1578 nt6.4□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 RNR3YIL066C 2610 nt6.4□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 YRA1YDR381W 681 nt6.4□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 MOG1YJR074W 657 nt6.4□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 PUS5YLR165C 765 nt6.4□□□□□ -1.38
LSP1Q12230 BRF1YGR246C 1791 nt6.39□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 YCL065WYCL065W 369 nt6.39□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 PRS1YKL181W 1284 nt6.39□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.39□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 VHS1YDR247W 1386 nt6.39□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 GCS1YDL226C 1059 nt6.38□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 MTW1YAL034W-A 870 nt6.38□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 MRK1YDL079C 1506 nt6.38□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 HRP1YOL123W 1605 nt6.38□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 ACF2YLR144C 2340 nt6.37□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 UGO1YDR470C 1509 nt6.37□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 FLC3YGL139W 2409 nt6.37□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 SNT2YGL131C 4212 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 VBA1YMR088C 1689 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 OXP1YKL215C 3861 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 SSY5YJL156C 2100 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 PGA3YML125C 939 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 ENV7YPL236C 1095 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 CST6YIL036W 1764 nt6.36□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 SHM1YBR263W 1473 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 DFM1YDR411C 1026 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 YDR541CYDR541C 1035 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 YNR048WYNR048W 1182 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 YPR195CYPR195C 330 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 ATE1YGL017W 1512 nt6.35□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 ROG3YFR022W 2202 nt6.34□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 SHE10YGL228W 1734 nt6.34□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 HES1YOR237W 1305 nt6.34□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 ECM19YLR390W 339 nt6.34□□□□□ -1.39
LSP1Q12230 SYG1YIL047C 2709 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 EMW1YNL313C 2715 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 IRS4YKR019C 1848 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 DAK1YML070W 1755 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 DED81YHR019C 1665 nt6.33□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 GUP2YPL189W 1830 nt6.32□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 FHN1YGR131W 525 nt6.32□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 LEM3YNL323W 1245 nt6.32□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 CIT3YPR001W 1461 nt6.31□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 LCP5YER127W 1074 nt6.31□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 RAT1YOR048C 3021 nt6.31□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 UBX2YML013W 1755 nt6.31□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ECM3YOR092W 1842 nt6.3□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 YNL165WYNL165W 1221 nt6.3□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 YMR027WYMR027W 1413 nt6.3□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 QDR1YIL120W 1692 nt6.3□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 BIT2YBR270C 1638 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 MRF1YGL143C 1242 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ERG7YHR072W 2196 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 PAN6YIL145C 930 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 YJL171CYJL171C 1191 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ZRT2YLR130C 1269 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ATP4YPL078C 735 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ASN1YPR145W 1719 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 UBC4YBR082C 447 nt6.29□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 SED4YCR067C 3198 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 MAK32YCR019W 1092 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 RML2YEL050C 1182 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 PRS2YER099C 957 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 PRE3YJL001W 648 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 RMA1YKL132C 1293 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 ODC2YOR222W 924 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 NSE5YML023C 1671 nt6.28□□□□□ -1.4
LSP1Q12230 TRP1YDR007W 675 nt6.27□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 SPO7YAL009W 780 nt6.27□□□□□ -1.41
LSP1Q12230 YLR184WYLR184W 348 nt6.27□□□□□ -1.41
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