Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FMODQ06828 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FMODQ06828 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FMODQ06828 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FMODQ06828 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FMODQ06828 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FMODQ06828 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FMODQ06828 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FMODQ06828 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FMODQ06828 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
FMODQ06828 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FMODQ06828 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FMODQ06828 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FMODQ06828 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FMODQ06828 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FMODQ06828 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FMODQ06828 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FMODQ06828 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FMODQ06828 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FMODQ06828 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FMODQ06828 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms