Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GABPAQ06546 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GABPAQ06546 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms