Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DEUP1Q05D60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEUP1Q05D60 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEUP1Q05D60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms