Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NHLH1Q02575 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NHLH1Q02575 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NHLH1Q02575 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NHLH1Q02575 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms