Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PRCDQ00LT1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRCDQ00LT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms