Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA4Q00056 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXA4Q00056 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA4Q00056 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms