Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP2R2BQ00005 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP2R2BQ00005 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPP2R2BQ00005 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms