Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SKOR1P84550 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SKOR1P84550 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKOR1P84550 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms