Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAP84074 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPCAP84074 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPCAP84074 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAP84074 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPCAP84074 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAP84074 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAP84074 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAP84074 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPCAP84074 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPCAP84074 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAP84074 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAP84074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPCAP84074 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPCAP84074 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPCAP84074 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPCAP84074 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAP84074 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAP84074 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAP84074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPCAP84074 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAP84074 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPCAP84074 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPCAP84074 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPCAP84074 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPCAP84074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPCAP84074 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPCAP84074 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPCAP84074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPCAP84074 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPCAP84074 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HPCAP84074 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPCAP84074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms