Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEP78395 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRAMEP78395 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRAMEP78395 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms