Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSCP56915 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSCP56915 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSCP56915 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSCP56915 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSCP56915 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSCP56915 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GSCP56915 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GSCP56915 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GSCP56915 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSCP56915 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSCP56915 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSCP56915 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSCP56915 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSCP56915 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSCP56915 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GSCP56915 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSCP56915 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSCP56915 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSCP56915 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GSCP56915 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSCP56915 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSCP56915 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GSCP56915 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GSCP56915 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSCP56915 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSCP56915 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSCP56915 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GSCP56915 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSCP56915 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSCP56915 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSCP56915 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSCP56915 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSCP56915 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSCP56915 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSCP56915 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSCP56915 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GSCP56915 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms