Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC12A3P55017 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC12A3P55017 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC12A3P55017 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms