Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLNS1AP54105 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLNS1AP54105 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLNS1AP54105 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms