Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPOXP50336 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPOXP50336 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPOXP50336 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPOXP50336 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPOXP50336 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPOXP50336 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPOXP50336 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPOXP50336 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPOXP50336 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPOXP50336 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PPOXP50336 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PPOXP50336 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPOXP50336 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPOXP50336 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PPOXP50336 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PPOXP50336 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPOXP50336 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPOXP50336 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PPOXP50336 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PPOXP50336 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms