Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC34P49427 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC34P49427 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDC34P49427 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC34P49427 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC34P49427 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDC34P49427 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC34P49427 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC34P49427 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC34P49427 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC34P49427 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC34P49427 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC34P49427 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC34P49427 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms