Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRB2P47870 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GABRB2P47870 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRB2P47870 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms