Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GALR1P47211 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GALR1P47211 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GALR1P47211 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GALR1P47211 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GALR1P47211 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GALR1P47211 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GALR1P47211 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GALR1P47211 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GALR1P47211 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GALR1P47211 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GALR1P47211 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GALR1P47211 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GALR1P47211 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GALR1P47211 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GALR1P47211 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GALR1P47211 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GALR1P47211 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms