Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP5P45974 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP5P45974 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP5P45974 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP5P45974 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP5P45974 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP5P45974 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP5P45974 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP5P45974 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP5P45974 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP5P45974 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP5P45974 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP5P45974 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP5P45974 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP5P45974 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
USP5P45974 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP5P45974 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP5P45974 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP5P45974 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP5P45974 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP5P45974 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP5P45974 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP5P45974 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP5P45974 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP5P45974 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP5P45974 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP5P45974 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP5P45974 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP5P45974 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP5P45974 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP5P45974 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP5P45974 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP5P45974 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP5P45974 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP5P45974 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP5P45974 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms